A Harley Quinn – Blazing Shadows Harley Jokertől való megváltásának történetét meséli el. Körülbelül öt évvel a Jokertől való szakítása után játszódik, és kiderül, hogy Harley visszaköltözött szülővárosába, Brooklynba, ahol felnőtt, és most párkapcsolatban él barátnőjével, Poison Ivyvel. Ennyi év után azonban mára már egészen "középosztálybeli életében" lassan vágyódni kezd a régi szép idők után, amikor bankokat rabolt ki, és a Joker iránti nagy érzelmek vezérelték, és sok nagy kalandban volt része.